中二员
给事中六员 【旧八员、万历九年、革四员、十一年、復设二员】
礼科
都给事中一员 左右给事中二员
给事中五员 【旧六员、万历九年、革二员、十一年、復设一员】
兵科
都给事中一员 左右给事中二员
给事中七员 【旧十员、万历九年、革五员、十一年、復设二员】
刑科
都给事中一员 左右给事中二员
给事中六员 【旧八员、万历九年、革四员、十一年、復设二员】
工科
都给事中一员 左右给事中二员
给事中四员
承天门 【待詔一员、阁门使四员、观察使十员、后俱革】
钦天监
正官
监正一员 监副二员
首领官
主簿一员
属官
春、夏、中、秋、冬官正各一员
五官灵臺郎四员 【旧八员】
五官保章正一员 【旧二员】
五官挈壶正一员 【旧二员】
五官监候二员 【旧三员】
五官司历二员
五官司晨二员 【旧六员】
漏刻博士一员 【旧六员】
【旧有回回监官、后俱革、止设回回科博士三员、今亦革】
太医院
正官
院使一员
院判二员 【旧一员】
首领官
吏目十员 【旧止一员、后以医士年深考陞、不拘定员、在内於圣济殿、在外於本院。及各差供事。隆庆五年、定為十员】
属官
御医十员 【旧止四员、后增至十八员、隆庆五年、定為十员】
所属衙门
惠民药局
大使一员 副使一员
生药库
大使一员 副使一员
上林苑监
正官
左右监正二员 左右监副二员
左右监丞二员 【后监正、监副、俱不常设、止设监丞、署掌印信】
首领官
典簿一员
属官
良牧署
典署一员 【久住补】 署丞一员 【旧二员】
录事一员 【旧二员、后革一员、万历九年尽革、十一年、復设一员】
蕃育署
署丞一员 【旧二员】
录事一员 【旧二员、后革一员、万历九年尽革、十一年、復设一员、旧有典署一员、隆庆元年革】
林衡署
典署一员 【久住补】
署丞一员 【旧二员旧有录事二员、后革】
嘉蔬署
署丞一员 【旧二员旧有典署、录事、各一员、嘉靖三十一年革】
中、左、右、前、后、五军都督府经歷司
经歷各一员 都事各一员
断事司 【后革。旧有断事官一员、左右断事官二员、提控案牘二员、司务二员、司狱一员、中左右前后五司、稽仁、稽义、稽礼、稽智、稽信、各一员、后俱革】
锦衣卫经歷司
经歷一员
各卫经歷司
经歷各一员 【共七十三员、旧各有知事一员、革、济州等五卫、各添收粮经歷一员、万历九年革】
仓副使各一员 【旧有大使各一员、后革】
京卫武学
教授一员
训导四员 【旧六员】
留守中等卫各门千户所 【旧有吏目各一员、后革】
牧马千户所
吏目一员
蕃牧千户所
吏目一员
奠靖千户所
吏目一员
中、东、西、南、北、五城兵马指挥司 【惟中城止称中兵马指挥司】
正官
指挥各一员
副指挥各四员 【旧各四员、后增至六员、嘉靖三十六年、五司各革一员、隆庆三年、五司各革一员、今各设四员】
首领官
吏目各一员
僧录司
左右善世二员 左右阐教二员
左右讲经二员
左右觉义二员 【俱不支俸】
道录司
左右正一二员 左右演法二员
左右至灵二员
左右玄义二员 【俱不支俸】
神乐观
提点一员 知观二员
大明会典卷之三
【官制二】
【南京官】
南京官裁减不一、今止书其见设者
南京宗人府
经歷一员
南京吏部
尚书一员
右侍郎一员 【万历三年革、十一年復设】
司务一员
文选清吏司郎中一员 主事一员
验封清吏司郎中一员 【旧有主事一员、隆庆四年革】
稽勋清吏司郎中一员 【旧有主事一员、后革】
考功清吏司郎中一员 主事一员
南京户部
尚书一员
右侍郎一员 【嘉靖二十六年、革南京粮储都御史、以本部侍郎督理粮储】
司务一员
照磨所
照磨一员
浙江清吏司郎中一员 员外郎一员
主事一员
江西清吏司郎中一员
员外郎一员 【隆庆四年革、万历十一年復设】
主事二员 【旧一员】
福建清吏司郎中一员 员外郎一员
主事一员
湖广清吏司郎中一员
员外郎一员 【万历九年革、十一年復设】
主事一员
广东清吏司郎中一员 员外郎一员
主事一员 【旧二员、内一员管黄册、隆