蠲缓,实惠不及於民。有所谓挖徵、急公等名目,无一非蠹国病民。凡下与上交接之事,诿之幕友;官与民交接之事,诿之门丁。词讼案牍,病在积压;盗贼奸宄,弊在因循。州县之小事,即百姓之大事,今日之小贼,即异日之大贼。厝火积薪,隐忧方大。又如捐输则有踩堂、贽见之费,牙帖则有勒索之费,釐金则有私设之费。臣受事以来,迭次特参,在国自有刑章,在臣甘为怨府。惟思劾贪非难,求才为难。前者劾去,后者踵事,而巧避其名,弊将不可胜言。臣愚以为必严禁官场应酬陋习,与群吏更始,崇尚敦朴,屏退浮华。行之数年,庶可改观。目下州县悬缺待人,请敕下部臣,暂勿拘臣文法资格。此吏治急应整饬之要。武汉甫经收复,人或以为已治已安,臣窃忧之。如以为治安,则前收复已二次矣。况江西七府俱沦於贼,旁轶横出,不仅九江、安庆为足虑也。未收复之前,事势极难,文武尚有惧心;收复之后,布置尚易,而特恐文武均萌肆志。外省粉饰之习,久在圣明洞鉴。不揣愚昧,用以直陈。”疏入,上嘉纳焉。於是裁浮勇,练新军,蠲四十六州县田赋以苏民困。设清查局,稽核全省仓库盈虚之数;设节义局,表彰死难官绅士女;设军需局,以备东征饷械。严课吏治,纠劾文武数十人,推廉尚能,手书戒勉将吏如子弟。初,将吏颇构督、抚异同,下令曰:“敢再言北岸兵事吏事长短者,以造言论罪。”官文亦开诚相与,无掣肘。军政吏治,皆林翼主稿,林翼推美任过,督抚大和。湖北振兴,实基於此。襄阳土匪猖獗,扰及河南境,令唐训方等剿之。
七年春,擒匪首高先二等。陈玉成由皖北上犯,诸军不能御。林翼赴黄州督师,贼众十馀万环踞巴河东。会水涨,林翼令毁三台河石桥,扼河而守。潜师出回龙山,遏贼上窜。调李续宜率湖勇驰至,督诸军合击於孙家嘴、马家河、月山,贼大败遁走。都兴阿、李续宾亦连破贼於黄梅、宿松,楚北肃清。遂视师九江,定合围方略而还。八年四月,李续宾等攻九江,克之,磔贼首林启荣。诏嘉林翼调度有方,加太子少保。林翼乃急规安庆,杨岳斌率水师出九江,都兴阿出宿松、望江,逼安庆为围师。李续宾规复太湖、潜山、桐城,与都军为犄角。五月,丁母忧,诏予假百日治丧,假满仍署巡抚。七月,庐州陷,李续宾轻军赴援,战殁三河。林翼方奉母柩回籍,诏急起视师,林翼闻命,痛哭起行,迳次黄州,军心始定。
九年,进屯上巴河,与李续宜整饬部伍,日夜训练,谋大举。会石达开由江西犯湖南,围宝庆。林翼令李续宜率所部赴援,舒保马队助之,又以水师分扼河道,宝庆围得解,於是与曾国籓合力图复安徽。国籓循江而下为第一路,多隆阿、鲍超攻取潜山、太湖为第二路,林翼自出英山、霍山为第三路,李续宜由松子关出商城、固始为第四路。十月,由黄州移营英山。陈玉成在贼中最狡悍,见太湖围急,纠合捻匪张洛行、龚瞎子众数十万来援。林翼集诸军精锐全力备战,欲一鼓歼之。与曾国籓部署诸将,指挥战略。谋前敌总统,以多隆阿谋勇兼优,而鲍超素不相下,手书劝勉,十数往复,始定议。又备意外,令金国琛、余际昌以八千人出潜山天堂拊贼背。十二月,贼至,鲍超营小池驿,当其冲,贼聚攻之。多隆阿虑分兵掣全势,置不救,调唐训方往助。事且急,金国琛等由山中鼓行而出,贼乃夺气。十年正月,多隆阿攻罗山冲为西路,鲍超出小池驿为东路,硃品隆、蒋凝学、唐训方等合击,金国琛等亦同时并进,大破贼,歼毙先后二万馀,遂克太湖城,潜山亦复。是役为仅见之大捷,安庆之势遂孤。
既而江南大军溃,苏、常尽陷,曾国籓授两江总督,督师。林翼为画分路大举之策,国籓不尽用,率鲍超等次祁门,为规复江南计,以其弟国荃围安庆。林翼令多隆阿围桐城,李续宜屯青草塥,为两军援,都兴阿别出师江北,分兵济饷,林翼悉任之。十月,多隆阿、李续宜大破贼於桐城挂车河。林翼进驻太湖,度贼援安庆不利,必深入湖北腹地以分我军势。令余际昌屯霍山乐兒岭,成大吉屯罗田松子关,戒贼至勿浪战,坚守待援。十一年春,贼果合捻匪西犯,成大吉破之松子关,歼捻渠龚瞎子。霍山守者违节度,为贼所败,遂进陷黄州、德安、孝感、随州,林翼令李续宜回援。贼复分股回略蕲、黄,趋安庆,约城贼夹击。檄成大吉下援,鲍超亦由南岸至,破贼於集贤关,擒斩数千,磔其渠刘瑲林。多隆阿亦破援贼於桐城,贼计不得逞,城中粮将尽,势益慼。南岸之贼复由江西犯兴国、大冶,南及崇、通,武汉震动。林翼方病咯血,自率师回援,而围攻安庆益急。及抵湖北,贼已闻风遁。八月朔,遂克安庆。曾国籓推林翼为首功,诏加太子太保,予骑都尉世职。桐城、庐江、舒城以次复,黄州、德安之贼先后擒斩,楚境悉平。
林翼久病,闻文宗崩於热河行在,大恸呕血,八月,卒。诏赠总督,祀贤良祠,湖北、湖南并建专祠,赐其子子勋举人,谥文忠。同治元年,复诏:“林翼未竟全功,遽就溘逝,迹其功勋卓越,名播寰区,至今江、鄂士民称颂。命於原籍家祠赐祭一坛。”洎江南平,加予一等轻车都尉世职,子子勋袭,后并两世职为男爵。光绪中,